Un bakteriológiai vizsgálat vagy elemzés lehetővé teszi, hogy megtalálja és azonosítsa baktériumok részt vett a fertőzés.

A fertőzés helyétől függően számos elemzés lehetséges:

• bakteriológiai vizsgálata vizelet vagy az EKB
• bakteriológiai vizsgálata ebben (lásd a szárkultúrát)
• bakteriológiai vizsgálata cervico-hüvelyi váladék nőknél
• bakteriológiai vizsgálata sperma emberekben
• bakteriológiai vizsgálata hörgő váladék vagy köpet
• bakteriológiai vizsgálata torok tamponok
• bakteriológiai vizsgálata bőrfekélyek
• bakteriológiai vizsgálata gerincvelői folyadék (lásd az ágyéki punkciót)
• bakteriológiai vizsgálata vér (lásd a vérkultúrát)

Ezt a fajta vizsgálatot nem írják elő szisztematikusan fertőzés esetén. Leggyakrabban, bakteriális eredetű fertőzéssel szembesülve, az orvos empirikusan írja fel az antibiotikumokat, azaz „véletlenszerűen”, ami az esetek többségében elegendő.

Azonban számos helyzetben szükség lehet mintavételre és pontos bakteriológiai elemzésre:

• fertőzés immunhiányos személyben
• fertőzés, amely nem gyógyul antibiotikumokkal (és ezért valószínűleg rezisztens az első antibiotikumokkal szemben)
• kórházi fertőzés (kórházban fordul elő)
• potenciálisan súlyos fertőzés
• kollektív ételmérgezés
• kétség a fertőzés vírusos vagy bakteriális jellegével kapcsolatban (például angina vagy garatgyulladás esetén)
• bizonyos fertőzések, például a tuberkulózis diagnosztizálása
• elvisszük helyi falvakba ahol megismerkedhet az őslakosok kultúrájával; ...